超声波清洗机都带有温度调节功能，一般范围是常温至95度可调，清洗时的具体温度要求可根据所清洗的物件及污垢来决定。其次，清洗温度升高，有利于空化的产生，但温度过高，气泡内的蒸气压增加，空化强度降低。因此，温度的选择应考虑对空化强度的影响，还要考虑清洗液的化学清洗效果。每种清洗液都有自己适宜的温度范围。
一般情况下，超声波清洗机设备中的水清洁剂的适宜清洗的温度为40~60℃之间，尤其是在那寒冷的天气里，洗涤液温度过低的话产生的气穴现象效果也不好，洗涤效果也不好。因此，一些清洗机设备会通过被围绕在清洗滚筒外部的电热丝加热以控制温度，在温度升高时容易产生气蚀，清洗的效果会更好。若温度持续上升时，腔内的气体压力会增加，冲击声压会降低，反映了这两个因素的相乘效果。
而如果清洗的物品有油污(油污类的污垢)的话，温度保持在50~60℃的清洗温度，主要是因为这个温度下的空化效果好，并且大部分活性酶是良好的活跃状态，是污渍分解良好的温度区间。所以如果需要除油污的话，温度应该保持在50~60℃为好。
超声波清洗机的工艺和清洗液在选择在购买之前，应该对被清洗件做明确的分析，明确被洗件的材料构成、结构和数量，分析并明确要清除的污物，这些都是决定所要使用什么样的清洗方法，判断应用水性清洗液还是用溶剂的先决条件。终的清洗工艺还需做清洗实验来验证。
